组织徽章是用来兑换顶级忍者碎片的资源，顶级要塞徽章和普通要塞徽章的兑换也会用到它。或者组织徽章的方法有很多，最主要的方法就是组织活动主题。每周六的要塞争夺战一定要参和，成功占领要塞的组织成员可以获取含有银徽章的宝箱，组织首领还能每天分配5个普通宝箱给成员。提议玩家优先加入活跃度高、实力强的组织，这样更容易在要塞战中取胜并稳定获取徽章。

跨服要塞战是获取金徽章的主要途径，只有获取资格的组织才能参和。这类活动主题通常在每月举办，即使没有取胜，参和也能获取奖励宝箱。跨服要塞战奖励的宝箱内容会更丰厚，组织首领每周还可以分配5个跨服宝箱。因此平民或者新人玩家一定要积极参和这些活动主题，这些都是积累徽章的决定因素方法。除了要塞战，组织首领每天祈福和叛忍来袭等活动主题也会产出少量的徽章。叛忍来袭活动主题结束后，组织成员可以领取包含功勋的宝箱，这些功勋可以在组织商店兑换部分资源。

尝试服方法可以参和集合阶段挑战，打满次数就能获取30个要塞徽章，进入第二阶段的组织成员还能获取顶级要塞徽章。组织商店中可以用10个顶级要塞徽章兑换1个S级忍者碎片，每周最多兑换6个碎片。优先选纲手和仙人自来也这种战力强的，按照这个进度兑换1个完整的S忍者需要半年时刻。